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Jmol è un'applicazione software versatile creata utilizzando Java che consente agli utenti di visualizzare modelli 3D di strutture chimiche. Consente la visualizzazione di atomi che formano composti da varie prospettive. L'applicazione include sia uno strumento desktop (Jmol) che un add-on di navigazione web (JmolApplet) che consente agli utenti di esplorare le strutture molecolari sulle pagine web.
Inoltre, Jmol offre una utility in grado di generare pagine web da file compatibili, consentendo agli utenti di personalizzare le viste 3D con dettagli come misurazioni atomi e informazioni sugli elementi. Il programma supporta anche animazioni e vibrazioni per una maggiore visualizzazione. Può esportare i file in vari formati tra cui JPG, PNG, PPM, PDF e PovRay.
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